Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT21O43809 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUDT21O43809 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDT21O43809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms