Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN6O43657 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN6O43657 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms