Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRS3O43559 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRS3O43559 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRS3O43559 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRS3O43559 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRS3O43559 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRS3O43559 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRS3O43559 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRS3O43559 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRS3O43559 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRS3O43559 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRS3O43559 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRS3O43559 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRS3O43559 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRS3O43559 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRS3O43559 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRS3O43559 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRS3O43559 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRS3O43559 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRS3O43559 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FRS3O43559 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FRS3O43559 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRS3O43559 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRS3O43559 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRS3O43559 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRS3O43559 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRS3O43559 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRS3O43559 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms