Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBFA2T2O43439 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBFA2T2O43439 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBFA2T2O43439 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms