Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLOCKO15516 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLOCKO15516 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms