Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN6O15212 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN6O15212 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms