Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNMO15061 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNMO15061 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNMO15061 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNMO15061 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNMO15061 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNMO15061 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNMO15061 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNMO15061 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNMO15061 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNMO15061 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNMO15061 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNMO15061 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNMO15061 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNMO15061 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNMO15061 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNMO15061 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNMO15061 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNMO15061 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNMO15061 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNMO15061 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNMO15061 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNMO15061 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNMO15061 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNMO15061 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNMO15061 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNMO15061 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNMO15061 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNMO15061 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNMO15061 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNMO15061 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNMO15061 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNMO15061 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNMO15061 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNMO15061 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNMO15061 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNMO15061 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNMO15061 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNMO15061 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNMO15061 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.01
SYNMO15061 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNMO15061 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNMO15061 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNMO15061 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNMO15061 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNMO15061 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNMO15061 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNMO15061 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNMO15061 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNMO15061 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNMO15061 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNMO15061 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNMO15061 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNMO15061 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNMO15061 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNMO15061 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNMO15061 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNMO15061 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNMO15061 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNMO15061 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNMO15061 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNMO15061 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNMO15061 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNMO15061 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms