Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRTO14522 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRTO14522 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRTO14522 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
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