Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHDO14521 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHDO14521 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHDO14521 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHDO14521 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHDO14521 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHDO14521 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHDO14521 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHDO14521 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHDO14521 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHDO14521 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHDO14521 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHDO14521 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHDO14521 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHDO14521 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHDO14521 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHDO14521 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHDO14521 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHDO14521 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHDO14521 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHDO14521 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHDO14521 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms