Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME4O00746 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME4O00746 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME4O00746 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME4O00746 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NME4O00746 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME4O00746 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME4O00746 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME4O00746 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME4O00746 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME4O00746 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME4O00746 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME4O00746 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME4O00746 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME4O00746 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME4O00746 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME4O00746 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NME4O00746 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME4O00746 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME4O00746 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME4O00746 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME4O00746 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME4O00746 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME4O00746 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME4O00746 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME4O00746 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms