Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC7O00311 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC7O00311 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC7O00311 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC7O00311 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC7O00311 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC7O00311 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC7O00311 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC7O00311 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC7O00311 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC7O00311 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC7O00311 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC7O00311 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC7O00311 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC7O00311 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC7O00311 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC7O00311 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC7O00311 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC7O00311 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC7O00311 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC7O00311 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms