Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFXAPO00287 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFXAPO00287 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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