Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KRW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KRW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KRW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KRW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KRW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
J3KRW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KRW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KRW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KRW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms