Protein–RNA interactions for Protein: H7C423

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C423 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C423 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C423 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C423 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C423 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H7C423 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H7C423 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C423 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C423 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H7C423 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C423 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C423 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C423 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C423 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms