Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP99D6REC4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP99D6REC4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms