Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN25C9JDP6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLDN25C9JDP6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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