Protein–RNA interactions for Protein: B4DZS4

TCP11X1, T-complex protein 11 X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11X1B4DZS4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCP11X1B4DZS4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCP11X1B4DZS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCP11X1B4DZS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP11X1B4DZS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP11X1B4DZS4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP11X1B4DZS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP11X1B4DZS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCP11X1B4DZS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms