Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4DEV8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4DEV8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DEV8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DEV8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DEV8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DEV8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DEV8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DEV8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DEV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DEV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DEV8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DEV8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DEV8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DEV8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DEV8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DEV8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DEV8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DEV8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DEV8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DEV8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DEV8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DEV8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DEV8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms