Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229AB2RXF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229AB2RXF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229AB2RXF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms