Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ISM1B1AKI9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ISM1B1AKI9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ISM1B1AKI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms