Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PP2D1A8MPX8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PP2D1A8MPX8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PP2D1A8MPX8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms