Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOBPA7XYQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SOBPA7XYQ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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