Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms