Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDR42E2A6NKP2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDR42E2A6NKP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms