Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM200CA6NKL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM200CA6NKL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms