Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP5A6NIR3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGAP5A6NIR3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP5A6NIR3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP5A6NIR3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGAP5A6NIR3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms