Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC10BA6NIK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC10BA6NIK2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms