Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCP1A6NGW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCP1A6NGW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCP1A6NGW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms