Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF316A6NFI3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ZNF316A6NFI3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZNF316A6NFI3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms