Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA8A3KMH1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWA8A3KMH1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms