Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBC2A0A5B9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBC2A0A5B9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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