Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0B4J2C4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms