Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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