Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms