Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms