Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms