Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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