Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDP1Q9NUW8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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