Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms