Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM60AQ9NP50 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM60AQ9NP50 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms