Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDFQ9HBH1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms