Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms