Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEP44Q9C0F1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms