Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC2Q9C0B9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms