Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms