Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms