Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms