Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FYCO1Q9BQS8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms