Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms