Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms